Program Magister Kajian Ketahanan Nasional memilki 8 peminatan, antara lain:
- Kajian Stratejik Ketahanan Nasional
- Kajian Stratejik Intelijen
- Kajian Stratejik Pengembangan Kepemimpinan
- Kajian Stratejik Kebijakan dan Manahemen Lembaga Pemasyarakatan
- Kajian Stratejik Penanganan Narkoba
- Kajian Stratejik Imigrasi
- Kajian Stratejik Penegakan Hak Asasi Manusia
- Kajian Stratejik Perencanaan, Strategi dan Kebijakan
Jalur masuk Magister Kajian Ketahanan Nasional ditempuh melalui SIMAK dengan ujian tertulis.
Biaya Pendidikan
BOP (Biaya Operasional Pendidikan) Magister Kajian Ketahanan Nasional dibayarkan sejumlah Rp11.000.000,00 untuk kelas reguler pada Program Magister Ketahanan Nasional. Untuk kelas khusus Ketahanan Nasional dan kelas reguler peminatan lainnya dibayarkan sejumlah Rp15.000.000,00 per semesternya. DP (Dana Pengembangan) yang hanya dibayarkan saat awal masuk kuliah sebesar Rp6.000.000,00 untuk kelas reguler dan kelas khusus.